为了保证长期安全储存，大豆的含水率通常要降到13％。才能入库储藏。用塔式干燥机干燥时，豆粒的受热温度不超过30～35℃，干燥介质温度为60～80℃，处理时间为40～45分钟；采用双级干燥时，第一级干燥介质温度为90℃，豆温为25℃，第二级的干燥介质为80℃，豆温35℃。大豆一次干燥降水不低于3％～6％，降水速率约为3％／小时。
①干燥贮藏法：一是用日光暴晒；二是用设备烘干。
②通风贮藏：大豆在贮藏过程中，要保持良好的通风条件，使干燥的低温空气不断地穿过大豆籽粒间，可以降低温度，减少水分，防止局部发热、霉变。
③低温贮藏：低温贮藏主要是通过隔热和降温两种手段来实现的，除冬季可利用自然通风降温以外，一般需要在仓房内设置隔墙、隔热材料隔热，并附设制冷设备，此法一般费用较高。
④密闭贮藏：包括全仓密闭和单包装密闭两种，全仓密闭贮藏时对建筑要求高，费用多，单包装密闭贮藏可用塑料薄膜包装，此法用于小规模效果好，但也要注意水分含量不宜高，否则亦会发生变质(主要是酸价升高，出油率降低)。
⑤化学贮藏法：在大豆贮藏以前或贮藏过程中，在大豆中均匀地加入某种能够钝化酶、杀死害虫的药品，从而达到安全储藏的目的。化学贮藏法一般成本较高，而且要注意杀虫剂的防污染问题。
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