生物质锅炉除尘器温度调整用袋式除尘器处理常温气体一般不成问题，但处理高温高湿气体时，初始运行，若不予热，滤袋容易打湿，网眼会严重堵塞，甚至无法运行。另外，滤袋若不充分干燥，往往会出现结露现象。准确预测袋式除尘器的露点是困难的，因此必须注意由于结露而造成的滤料网眼堵塞和除尘器机壳内表面的腐蚀问题。
粉尘的排出收集在灰斗的粉尘，既可以自动排出也可以手动排出，但必须按规定的顺序排出。运转初期，经常1天到数天都不排灰，这些粉尘在布袋上，一直达到生物质锅炉除尘器的最大容尘量为止，此后按顺序排出。粉尘排出的周期不正确，就不能形成稳定的运转制度。一般当回收的粉尘量过多的时候，多是因为最初设计的予定值不准确。如达不到灰尘量的予定值，开始时就必须不断的取出灰尘以控制回收量的多少。同时利用测定除尘效率得到的数据，按下式可求粉尘量。
